依據「金融監督管理委員會組織法」，金管會置主任委員 1 人，副主任委員 2 人，另財政部部長、經濟部部長及法務部部長為當然委員，行政院前於101年7月23日指派國家發展委員會主任委員兼任金管會委員。金管會本會下設有四業務處，包括綜合規劃處、國際業務處、法律事務處及資訊服務處；設有四輔助單位，包括秘書室、人事室、主計室及政風室；設有二任務編組，包括公共關係室及金融科技發展與創新中心。另為加強金管會與主要國際金融組織及金融主管機關之合作與交流、掌握國際主要金融市場發展，分別於紐約及倫敦設立代表辦事處。為落實執行對銀行、證券、期貨及保險業之管理、監督及檢查，金管會下設有四業務局，屬於三級機關，分別為銀行局、證券期貨局、保險局及檢查局。