為使本會得以順利於93年7月1日開始運作，行政院爰指定財政部林部長全出任金融監督管理委員會籌備小組召集人，積極辦理金管會籌備成立等相關事宜，籌備小組復依工作性質區分為企劃、總務、財務及人事等四個分組平行辦理，致資訊基礎建設則委由財政部財稅資料中心辦理規劃事宜。初期辦公地點嗣經籌備小組積極協調國有財產局與相關部會，金管會會本會及所屬機關合署辦公場所擇訂鐵路局板橋新站第七至八樓、十四至第十八層樓。